欢迎光临启东市天源泵业有限公司网站
设为主页
|
加入收藏
客户服务热线:
(+86 513 ) 83633228
E-mail:ty@qyby.com
首页
新闻资讯
公司简介
公司荣誉
产品展示
工程实例
联系我们
电子邮局
产品分类目录
> YQW型潜水电机
> QJB(T、G)型潜水搅拌机
> QSJ双曲面搅拌机
> QJW型潜水污泥回流泵
> QXB型潜水离心曝气机
> QLBC型自吸式螺旋曝气机
> QBJ型潜水搅拌、曝气两用机
> WQ(Y)型潜水排污泵
> Y2系列三相异步电动机
客户服务中心
启东市天源泵业有限公司
地址:江苏省启东市科技创业园永阳路388号
电话:0513-83630988 83633228
传真:0513-83639118
手机:13806282268
QQ: 512609843
首页
>>
综合资讯
>> 像乔布斯那样做一个基因组测序难吗
像乔布斯那样做一个基因组测序难吗
潜水电机
|
潜水搅拌机
|
潜水排污泵
|
曝气机
加入时间:
2019-12-16 10:16:17
点击:
次
像乔布斯那样做一个基因组测序难吗 基因组测序? 不少人对这个名字还有些陌生,但早在30多年前,人类基因组测序计划就已经成为破译人类遗传密码的大科学工程,并与曼哈顿原子弹计划、阿波罗登月计划并称为“20世纪人类三大科学计划”。 所谓基因组测序,就是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,锁定个人病变基因,提前预防和治疗。多年前,苹果公司创始人史蒂夫·乔布斯在确诊胰腺癌后,曾花费10万美元进行个人基因组测序,引发公众关注。 如今科技发展日新月异,完成一个人的全基因组测序,已经是普通实验室甚至家庭都可以负担得起的“平常事”。以当下火热的第三代测序为例,完成个人全基因组测序仅需1天时间,有的费用已经低于5万元。 不过,第三代测序技术也面临着一个尴尬困境:要完成这样数据规模的全基因组组装分析,需要消耗50万个CPU小时,只能在超大计算机集群上进行。这种情况下,同时对大量个体的全基因组进行组装分析,是难以想象的。 以全基因组组装方式对群体进行测序分析,成为生物和医学研究的趋势。生物信息学领域的科学家们,也致力于改变这种数据产出速度高于数据分析速度的尴尬状况,不断开发出更高效的组装分析算法。 如今,中国农业科学院农业基因组研究所博士阮珏与美国哈佛大学医学院博士李恒合作,研发出第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法——Wtdbg。 国际学术期刊《自然—方法学》(Nature Methods)近日刊发了这一成果的论文,其中提到,这一算法极大提高三代测序数据的分析效率,与今年4月科学家研发的Flye算法相比,分析速度提升了5倍,并首次将测序数据分析时间降低到少于测序数据产出时间。 据阮珏介绍,Wtdbg算法的开发得益于一个新的组装图理论的提出,将测序数据切分为固定长度的短串,再从短串构建出的图上恢复出全基因组序列。 “由于第二代测序错误率低,大部分短串是正确的,相同的短串间可以利用德布鲁因图的原理合并起来构成组装图。”阮珏说,突破性的方法基于突破性的理论基础。 从2013年开始,阮珏和李恒着手解决第三代测序组装的问题,随后在德布鲁因图基础上,设计出一个新的组装图理论——模糊布鲁因图。 “我们重新定义了‘短串’,新设计的模糊布鲁因图能够容忍高噪声数据,并随后对生成组装图与恢复基因组序列做了大量相应的重构,使其兼具高效率和高容错的优点。”阮珏说。 2016年,这一研究成果开始对所有人免费开放使用,不仅被几十篇学术论文引用,还被国内多家基因测序分析公司作为主要组装分析工具,并且在2019年世界大学生超算竞赛中做为性能测试赛题。 阮珏说,这一研究成果表明我国在基因组算法领域具有了引领国际的实力,也代表了我国科技发展的软实力。有了这个更快的全基因组组装方式,也将有更多的人从中受益,比如,像史蒂夫·乔布斯那样做一个基因组测序。 中国青年报·中国青年网记者 邱晨辉 来源:中国青年报
上一页:
“光棍节”能免费喝奶茶 这些中国节日外国人也爱过
下一页:
科技部部长:强化科技安全为国家安全提供强大科技支撑
[ 其它相关文章 ]
广州消防支队最帅“逆行者”: 一日三出警救四人
深圳福田拟推新模式 厨余垃圾“投放不脏污”
朝阳一项目多处房产涉嫌私搭乱建 相关方面称目前正在处理
网络差评师扰乱电商经营秩序 终要为失信“买单”
东湖高新区出台“新外资十条”加速国际化
台湾一公寓凌晨爆炸:捕蚊灯抓蚊子产生火花引爆
香港浸会大学宿舍疑因洒面粉庆生致粉尘爆炸 12名学生烧伤
上海街头惊现不明生物?浑身长刺体型较大,过马路还会看红绿灯?专家警告:不要擅自接触
广西大瑶山搬迁移民“幸福里”的新生活
南京为20万大学新生办开学典礼
地址: 江苏省启东市科技创业园永阳路388号 邮编:226200 苏ICP备05008941号
电话:0513-83630988 83633228 手机:13806282268 传真:0513-83639118
http://www.qyby.com E-mail:
maoxbin@163.com
潜水电机
潜水搅拌机
潜水排污泵
曝气机